Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cwc25-201ENSMUST00000018685 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm5315-201ENSMUST00000204430 1897 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cyp2b9-201ENSMUST00000082214 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms