Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Gm21818J3KMS6 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Gm21818J3KMS6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Gm21818J3KMS6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Gm21818J3KMS6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Gm21818J3KMS6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21818J3KMS6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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