Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms