Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Syce3B5KM66 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms