Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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