Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rrn3B2RS91 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rrn3B2RS91 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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