Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Cldn8Q9Z260 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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