Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms