Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Fhl3Q9R059 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms