Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nphp1Q9QY53 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms