Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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