Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms