Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Upk3aQ9JKX8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms