Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trem1Q9JKE2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trem1Q9JKE2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trem1Q9JKE2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trem1Q9JKE2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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