Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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OtofQ9ESF1 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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OtofQ9ESF1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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OtofQ9ESF1 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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OtofQ9ESF1 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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OtofQ9ESF1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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OtofQ9ESF1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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OtofQ9ESF1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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OtofQ9ESF1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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OtofQ9ESF1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms