Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ush1cQ9ES64 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ush1cQ9ES64 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms