Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms