Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smg9Q9DB90 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms