Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tvp23bQ9D8T4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Tvp23bQ9D8T4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Tvp23bQ9D8T4 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tvp23bQ9D8T4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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