Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Snx20Q9D2Y5 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms