Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9D2Q3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms