Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxxc1Q9CWW7 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms