Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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