Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tsnaxip1Q99P25 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms