Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Pacsin3Q99JB8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pacsin3Q99JB8 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pacsin3Q99JB8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pacsin3Q99JB8 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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