Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms