Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms