Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ubxn4Q8VCH8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubxn4Q8VCH8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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