Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vmn1r200Q8R281 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Vmn1r200Q8R281 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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