Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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