Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pramef8Q8CE24 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms