Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd4aQ8CBY1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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