Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp20Q8C6M1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp20Q8C6M1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp20Q8C6M1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Usp20Q8C6M1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Usp20Q8C6M1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Usp20Q8C6M1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Usp20Q8C6M1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Usp20Q8C6M1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp20Q8C6M1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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