Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg16l1Q8C0J2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms