Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtpaQ8BWP5 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms