Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc30Q8BVF4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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