Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gpc2Q8BKV1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms