Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms