Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NischQ80TM9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NischQ80TM9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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