Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms