Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms