Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc18Q640L5 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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