Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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AtrxQ61687 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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AtrxQ61687 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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AtrxQ61687 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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AtrxQ61687 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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AtrxQ61687 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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AtrxQ61687 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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AtrxQ61687 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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