Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp7Q60973 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms