Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rtl5Q5DTT4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rtl5Q5DTT4 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rtl5Q5DTT4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rtl5Q5DTT4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rtl5Q5DTT4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rtl5Q5DTT4 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms