Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r201-201ENSMUST00000091730 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc43Q3V0L5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms