Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmem253Q3UNB8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms