Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Puf60Q3UEB3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms