Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trafd1Q3UDK1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms