Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms